Huoli Itämeren tilasta sekä turhautuminen juhlapuheisiin toimivat lähtökohtana John Nurmisen Säätiön Puhdas Itämeri -hankkeelle vuonna 2004. Säätiön perimmäinen tehtävä - suomalaisen merellisen kulttuuriperinnön vaaliminen - ei tuntunut mielekkäältä, jos Itämeri kuolisi silmiemme edessä.
Säätiön hallitus kuuli johtavia meriympäristön asiantuntijoita, joiden viesti oli selkeä: nopein ja kustannustehokkain tapa kohentaa Itämeren tilaa olisi puuttua sen valuma-alueella sijaitsevien jätevedenpuhdistamoiden toimintaan tehostamalla niiden fosforinpoistomenetelmiä.
Puhdas Itämeri -hankkeet tehostavat fosforinpoistoa koko Itämeren valuma-alueella - Venäjällä, Puolassa, Latviassa, Virossa ja Valko-Venäjällä. Tavoitteena on merkittävästi vähentää Itämeren rehevöitymistä pienentämällä mereen yhdyskuntajätevesien mukana päätyviä fosforipäästöjä vuosittain 2500 tonnilla. Syksyllä 2010 Säätiön ensimmäinen projekti Pietarissa päättyy, ja Itämerestä vähenee vuosittain jo yli 1000 tonnia fosforia. Pietarin hanke onkin ympäristövaikutuksiltaan yksi merkittävimmistä Itämeren alueella koskaan toteutetuista vesiensuojeluhankkeista.
Säätiö toimii myös Suomenlahden tankkeriturvallisuuden parantamiseksi. Itämeri ei kestäisi suuren luokan öljyonnettomuutta, ja sattuessaan katastrofi tuhoaisi meren ja merenrannat vuosikymmeniksi. Tankkeriturva-hankkeessa luodaan, yhteistyössä merenkulun avaintoimijoiden kanssa, uusi ennakoiva alusliikenteen ohjausjärjestelmä, jonka käyttöönotto vähentää merkittävästi öljyonnettomuuden riskiä.
Tunnustamme, että Itämerellä on monia muitakin haasteita. On kuitenkin tärkeää osata suhteuttaa ongelmien mittasuhteet ja tarttua kiinni niihin, joita kohentamalla voidaan nopeasti ja tuloksekkaasti vaikuttaa Itämeren tilaan. Puhdas Itämeri -hankkeet toimivat määrätietoisesti ja tinkimättömästi, liike-elämästä lainatun ideologiansa mukaisesti, lopullisena tavoitteenaan tehdä oma työmme tarpeettomaksi Itämeren suojelussa.